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目的 探讨HBV C基因型较B基因型易引起肝炎慢性化的机制.方法 从GenBank分别下载C基因型和B基因型小S蛋白的氨基酸序列(即HBsAg),用CLustalW2.0生物软件分别比较C基因型和B基因型小S蛋白氨基酸序列的相似性;用神经网络的方法预测同基因型不同的小S蛋白氨基酸序列之间的T细胞表位的差异.结果 通过分别比较C基因型和B基因型小S蛋白的氨基酸序列的相似性,C基因型小S蛋白的氨基酸序列之间的相似性为(90～100)%,B基因型小S蛋白的氨基酸序列之间的相似性为(94～100)%;同基因型不同的小S蛋白氨基酸序列之间的T细胞表位存在明显差异.结论 C基因型小C蛋白的氨基酸序列之间较大的变异和同基因型不同的小S蛋白氨基酸序列之间的T细胞表位的差异可能是HBV C基因型较B基因型易引起肝炎慢性化的原因或部分原因.