利用COⅠ基因鉴别长三角地区常见嗜尸性蝇类

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目的 利用线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase subunitⅠ,COⅠ)基因序列对长三角地区常见嗜尸性蝇类物种进行分子鉴定并验证其可靠性.方法 于野外放置的大型家猪尸体上采集并经实验室多代培养、遗传稳定的长三角地区常见嗜尸性蝇类共3科6属7个物种,提取全基因组DNA后扩增COⅠ基因片段,正反向测序后拼接,通过Mega 7.0.26等软件分析扩增片段的碱基组成和种间进化分歧率,并采用邻接(neighbor joining,NJ)法和非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)构建长三角地区常见嗜尸性蝇类COⅠ基因序列的系统发育树.结果 不同蝇类物种的平均碱基组成为A(30.14%)、T(38.23%)、C(15.98%)、G(15.65%).种间进化分歧率在2.2%~15.3%,最低在大头金蝇和肥躯金蝇之间,最高在厩腐蝇和棕尾别麻蝇之间.结论 利用COⅠ基因能够较好地鉴别长三角地区的常见嗜尸性蝇类物种.
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