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eRNA AP003059.2与乳腺癌患者预后的相关性分析——基于TCGA数据库

来源 :浙江医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ilovebaidoudou

【摘 要】

：

目的通过人类癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选乳腺癌中关键的增强子RNA(eRNA),探讨其与乳腺癌患者预后的相关性。方法下载组织特异性增强子来源的长链非编码RNA(lncRNA)及其调控基因的列表,并下载TCGA数据库中相关的RNA测序数据和临床数据。通过生物信息学分析筛选与预后相关的eRNA,筛选标准为与肿瘤的总体存活率(Kaplan–Meier对数秩检验,P<0.05)和调控基因(相关系数r>0.4,P<0.001)具有显著相关性。结果与乳腺癌总体存活率相关性最强的eRNA是AP

【作 者】

：

王卫忠 何雪倩 冯杜金 陈燕敏 赵钊 

【机 构】

：

浙江省人民医院（杭州医学院附属人民医院）检验中心

【出 处】

：

浙江医学

【发表日期】

：

2021年15期

【关键词】

：

AP003059.2 长链非编码RNA 增强子 乳腺癌 苹果酸酶3 

【基金项目】

：

浙江省自然科学基金项目(LY18H160042),浙江省中医药科技计划项目(2021ZA014),浙江省医药卫生科技计划项目(2019KY278)。

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目的通过人类癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选乳腺癌中关键的增强子RNA(eRNA),探讨其与乳腺癌患者预后的相关性。方法下载组织特异性增强子来源的长链非编码RNA(lncRNA)及其调控基因的列表,并下载TCGA数据库中相关的RNA测序数据和临床数据。通过生物信息学分析筛选与预后相关的eRNA,筛选标准为与肿瘤的总体存活率(Kaplan–Meier对数秩检验,P<0.05)和调控基因(相关系数r>0.4,P<0.001)具有显著相关性。结果与乳腺癌总体存活率相关性最强的eRNA是AP

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