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新发疾病包括以前未知的病原体引起的疾病，和发病率逐渐升高或发病地理范围越来越大的原有疾病。新发病毒感染可分为虫传播（节肢动物媒介病毒或虫媒病毒）和动物或人间直接传播。临床上最重要的表现是出血性的或神经性的。出血性病毒在“病毒性出血热”一文中讨论。本文集中讨论嗜神经性虫媒病毒和一些其他的新发CNS病毒。