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射频干扰是影响微波医学成像质量的重要因素。分析了射频干扰对单频连续波成像系统的影响机理，针对同频率射频干扰问题，利用系统激励信号源和干扰信号源不相关的特点，提出对系统激励信号源初始相位按零均值随机相位编码的方法，可以将同频率干扰转变为零均值随机信号，进而再采用传统的均值滤波算法进行抑制。以乳腺癌二维微波医学成像为例，通过仿真成像实验验证了该方法的有效性。