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以西兰花基因组DNA为材料，对ISSR-PCR反应体系中各种影响因子如镁离子浓度、dNTP浓度、模板DNA含量、Taq DNA聚合酶量BSA浓度、引物用量、甘油浓度以及最适退火温度等进行了优化和筛选，建立了适合西兰花的ISSR反应体系：10 μl PCR反应体积，1×Taq酶配套缓冲液（10 mmol／L Tris·HCl，pH值9．0，50 mmol／L KCl，0．1％ Triton X-100），2．0 mmol／L MgCl2，0．75 U Taq酶，5ng模板DNA，12 p