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重大疫情的防控需要政府动员各方力量积极参与,但目前我国非政府组织在有效参与方面还面临着一定的现实困境,有待进一步优化.因而,对重大疫情防控中政府和非政府组织行为进行演化博弈分析确有必要.研究结果表明:在我国重大疫情防控中,非政府组织参与有限,政府和非政府组织之间的协作还有待优化;信任是政府和非政府组织行为博弈的关键因素.在重大疫情来临时,政府对非政府组织的信任和支持能够促进非政府组织的有效参与;政府应完善对非政府组织的支持措施体系并引导其积极参与重大疫情防控.另外,非政府组织也应不断提升自身能力,这有助于非政府组织在重大疫情防控中作用的优化.