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选取31个生态经济指标，以行政县（区）为单元，采用ISOTATA模糊聚类分析方法，把三峡库区分为4个农业生态经济区,即Ⅰ主城区城郊丘陵菜旅花牧加生态经济区、Ⅱ江万丘陵低山粮经果牧加生态经济区、Ⅲ武秭中山低山果林粮牧特生态经济区、Ⅳ兴宜低山中山丘陵林果牧粮生态经济区。通过对各区生态经济特征的分析，提出了其生态经济的发展方向和生态环境保护的策略，可为三峡库区农业可持续发展和生态环境保护提供理论依据。