【摘 要】
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目的:基于网络药理和分子对接方法探究丹参-川芎药对治疗脑梗死的作用机制.方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)检索并筛选丹参、川芎的有效成分及靶点;在GeneCards、OMIM数据库中查找脑梗死相关靶点;使用Cytoscape软件绘制韦恩图,得到丹参-川芎药对治疗脑梗死的潜在靶点,并通过String数据库构建蛋白相互作用关系网络;利用David数据库对排名靠前的靶点和通路进行GO功能注释和KEGG富集分析;使用AutoDock Vina软件对关键靶点和活性成分进行分子对接,并使用Pymol
【机 构】
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成都中医药大学, 四川 成都 610075;成都中医药大学附属医院, 四川 成都 610075
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目的:基于网络药理和分子对接方法探究丹参-川芎药对治疗脑梗死的作用机制.方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)检索并筛选丹参、川芎的有效成分及靶点;在GeneCards、OMIM数据库中查找脑梗死相关靶点;使用Cytoscape软件绘制韦恩图,得到丹参-川芎药对治疗脑梗死的潜在靶点,并通过String数据库构建蛋白相互作用关系网络;利用David数据库对排名靠前的靶点和通路进行GO功能注释和KEGG富集分析;使用AutoDock Vina软件对关键靶点和活性成分进行分子对接,并使用Pymol和DiscoveryStudio软件绘制对接结果.结果:从丹参-川芎药对中共挖掘出72种有效成分和61个潜在靶点,脑梗死相关靶点3110个,最终得到药物和疾病共有靶点47个.治疗疾病的重要靶点基因涉及EGFR、MYC、VEGFA、GASP3、IL6等,主要作用于PI3 K-Akt、AEG-RAGE、TNF等信号通路.分子对接结果显示丹参-川芎药对的主要化合物和核心靶点之间结合较好.结论:常用药对丹参-川芎可能通过EGFR、MYC、VEGFA等靶点发挥调节缺血区血管生成、对抗细胞凋亡、抗炎等功能,从而发挥在脑梗死疾病中的治疗作用.
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