地黄甲基转移酶/去甲基化酶基因的注释及其在块根发育过程中的表达分析

来源 :中国科技论文 | 被引量 : 0次 | 上传用户：qianpu1234

【摘要】

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利用Windows-BLAST软件同源比较分析获得地黄转录组中的DNA甲基转移酶/去甲基化酶基因,同时利用基因表达谱测序方法分析这些基因在地黄不同发育时期块根中的转录子水平。利用

【作者】

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廖登群祁建军李先恩孙鹏

【机构】

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中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所

【出处】

：

中国科技论文

【发表日期】

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2017年18期

【关键词】

：

中药资源地黄 DNA甲基转移酶 DNA去甲基化酶转录组块根发育数字基因表达谱 Chinese medicinal resource Rhemannia

【基金项目】

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高等学校博士学科点专项科研基金资助项目（0131106120029）,国家自然科学基金资助项目（81403039,81373915）

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利用Windows-BLAST软件同源比较分析获得地黄转录组中的DNA甲基转移酶/去甲基化酶基因,同时利用基因表达谱测序方法分析这些基因在地黄不同发育时期块根中的转录子水平。利用拟南芥11个C5-MTase和4个DMase基因的蛋白序列进行同源性比对,在地黄转录组中共获得了18个DNA甲基转移酶unigene和11个去甲基化酶unigene。差异表达基因（DEG）分析显示,11个DNA甲基转移酶unigene和5个去甲基化酶unigene在块根的发育过程中表达具有差异,随块根发育成熟转录子表达含量逐渐降低

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