水稻二化螟和三化螟基因组ddRADseq文库的构建

来源 :环境昆虫学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：HONEYMXR

【摘要】

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本文介绍了构建水稻二化螟和三化螟＂双酶切限制性酶切位点关联DNA测序＂（Double digest restrictionsite associated DNA sequencing,ddRADseq）文库的方法。利用安捷伦2100生物分

【作者】

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杨琼孙娜郑敏罗除成罗光华方继朝

【机构】

：

江苏省农业科学院植物保护研究所,南京农业大学植物保护学院

【出处】

：

环境昆虫学报

【发表日期】

：

2016年6期

【关键词】

：

基因组DNA文库 ddRADseq 生物分析仪水稻螟虫 ddRADseqgDNA libraryddRADseqbioanalyzerrice stem bo

【基金项目】

：

国家水稻产业技术体系项目（CARS-01-25）, 江苏省农业科技自主创新资金项目（CX（16）1001）, 江苏省农业科学院院基金项目（6111606）

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本文介绍了构建水稻二化螟和三化螟＂双酶切限制性酶切位点关联DNA测序＂（Double digest restrictionsite associated DNA sequencing,ddRADseq）文库的方法。利用安捷伦2100生物分析仪对4种单酶切及2种双酶切的酶切产物片段大小及分布范围进行分析,筛选出Mlu C I和Nla III两种限制性内切酶组合对螟虫基因组DNA进行酶切。酶切后的DNA片段两端连接上特定的P1、P2接头后,用Pippin Prep回收大小为285-435 bp的DNA片段。通

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