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发展优质高效养殖业,苗种是整个产业的关键,而良种又是苗种培育的基础.近年来,菲律宾蛤仔（福建俗称为花蛤）养殖死亡率高,苗种培育产量不稳定,原因主要是环境污染、养殖技术不规范和种质退化等问题所致.莆田市自1976年开展花蛤土池人工育苗试验，至今已有30年，育苗的亲贝均来自同一家系种群，由于近亲繁殖导致某些有害隐性基因从杂合状态转变为纯合状态而产生近交衰退，加之不定向选育，出现种质混杂、退化，导致性早熟、个体小型化、品质下降、生长缓慢、抗病力弱等问题，已成为制约产业发展的主要因素。