【摘 要】
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用葸醌类染料茜素红在0(ck),3(QSH1),7(QSH2),10 h(QSH3)分别处理白腐菌偏肿革裥菌,构建转录组,为研究白腐菌的细胞色素P450(CYP450)基因在脱色降解茜素红机制中的作用提供理
【机 构】
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东北林业大学林学院,哈尔滨150040;辽宁省杨树研究所,盖州115213
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用葸醌类染料茜素红在0(ck),3(QSH1),7(QSH2),10 h(QSH3)分别处理白腐菌偏肿革裥菌,构建转录组,为研究白腐菌的细胞色素P450(CYP450)基因在脱色降解茜素红机制中的作用提供理论支持.采用高通量测序技术对茜素红处理下的菌丝样本进行转录组测序,利用功能注释筛选出CYP450基因.结果 表明:4个转录组共得到26.17 Gb的有效数据,与参考基因组的比对效率为71.23％～73.66％,通过功能注释搜索所有基因,共得到96个CYP450基因.通过ck与QSH1、ck与QSH2、ck与QSH3的分组比较,对所有的CYP450基因进行差异表达筛选.其中,有3个基因(gene_24255、gene_ 18992、gene_7490)在3组对比中都出现.将这3个基因的0～10h的表达量与茜素红脱色率进行比较,得出这3个基因的表达量与脱色率呈正相关.通过对KEGG通路进行分析,发现gene_25488被注释到芳香化合物降解通路,初步印证了CYP450基因可能参与了偏肿革裥菌对茜素红染料的脱色.该研究从转录水平初步分析了偏肿革裥菌的CYP450基因及其产物可能参加了对茜素红降解脱色的相关代谢途径和生物学过程,获得的结果可为后续研究茜素红的降解机制提供参考.
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