研究目的：聚焦生态问题研究热点区域，鉴定不同生态区生态问题，提出不同生态区生态保护修复方向，以期为国家有针对性、有目的性、有方向性的开展生态保护与修复工作提供有效基础支撑。研究方法：研究热度评价模型、比较分析法和归纳总结法。研究结果：（1）20世纪80年代以来，我国生态问题研究热度总体呈增长态势，1998年以后生态问题的研究热度进入加速期，且在2012年掀起了新一轮的生态文明研究热潮。（2）我国各类生态问题研究热度存在明显的内部差异和空间差异，研究热度较高的生态问题主要是水土流失和生物多样性丧失，超过85%的城市均发表过关于这两个生态问题的学术论文，且研究热点区域集中在我国西部省份。（3）水土流失、荒漠化、生物多样性、林草湿地生态系统退化是各生态区重点关注的生态问题，超过半数的生态区重点关注森林生态系统退化；而石漠化、盐碱化、矿区生态退化等生态问题集中分布在几个脆弱生态区。超过80%生态区的主要生态问题都在3个及以上，这体现出我国多数生态区生态问题的紧迫性和复杂性。（4）各生态区生态保护修复方向存在差异，生态本底好且人类活动少的生态区以保育保护和自然恢复为主，此类生态区的保护修复重点应放在建立保护区、濒危生物的育种、繁殖、加强生物多样性监测等方面；生态本底一般的农业生态区或东部热带、亚热带生态林区以自然恢复和辅助再生为主，保护修复重点放在自然封育、人工造林种草、农林间作等方面。生境脆弱且人类活动频繁的生态区以辅助再生和生态重建为主，保护修复重点应放在各项工程类和物理、化学、生物类措施。研究结论：我国生态问题存在明显的差异，掌握不同区域生态问题的类型、严重程度和发生机制是开展国土空间生态保护修复工作的基础。