【摘 要】
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新型冠状病毒仍在全球范围内传播,至今尚未有针对此病毒的特效药上市。为了找到对新型冠状病毒3-胰凝乳样蛋白酶(3CL pro)具有潜在抑制活性的分子,以3CL pro晶体复合物结构(PDB ID:6LU7)为受体,运用分子对接方法对内部构建的由天然氨基酸构成的二肽分子库进行虚拟筛选。结合对接打分、自由能计算、分子有效性及相互作用模式分析,挑选具有潜在抗病毒活性的小肽分子,并对潜在活性分子进行药代动力学性质及毒性预测。结果发现,3个小肽分子(氨基酸组成:YH,YN,TW)不仅与3CL pro结合口袋处His4
【机 构】
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南京中医药大学附属中西医结合医院细胞与分子生物学实验室,上海市东方医院吉安医院药剂科,上海市东方医院吉安医院呼吸内科,中国药科大学生命科学与技术学院,株洲市二医院药剂科
【基金项目】
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江西省卫生健康委员会科技计划项目(202140994),吉安市指导性科技计划项目。
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新型冠状病毒仍在全球范围内传播,至今尚未有针对此病毒的特效药上市。为了找到对新型冠状病毒3-胰凝乳样蛋白酶(3CL pro)具有潜在抑制活性的分子,以3CL pro晶体复合物结构(PDB ID:6LU7)为受体,运用分子对接方法对内部构建的由天然氨基酸构成的二肽分子库进行虚拟筛选。结合对接打分、自由能计算、分子有效性及相互作用模式分析,挑选具有潜在抗病毒活性的小肽分子,并对潜在活性分子进行药代动力学性质及毒性预测。结果发现,3个小肽分子(氨基酸组成:YH,YN,TW)不仅与3CL pro结合口袋处His4
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