【摘 要】
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目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨三七治疗心房颤动的分子机制.方法 采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选三七活性成分及靶点,利用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-预测靶点网络.通过OMIM、DrugBank、GeneCards、DisGeNET数据库检索心房颤动相关靶点,利用STRING 11.0构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.2软件进行可视化分析.利用Metascape平台对交集靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组
【机 构】
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北京中医药大学 北京 100029;中国中医科学院广安门医院;中日友好医院 北京 100029
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目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨三七治疗心房颤动的分子机制.方法 采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选三七活性成分及靶点,利用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-预测靶点网络.通过OMIM、DrugBank、GeneCards、DisGeNET数据库检索心房颤动相关靶点,利用STRING 11.0构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.2软件进行可视化分析.利用Metascape平台对交集靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,借助Cytoscape 3.7.2软件构建三七活性成分-靶点-信号通路网络图,利用AutoDock软件进行分子对接并通过Pymol对结果进行可视化处理.结果 筛选出三七活性成分9个,三七-心房颤动交集靶点102个.GO分析主要得到6个生物学过程、4种分子功能和4条细胞组分表达过程,KEGG分析得到显著相关信号通路20条(P<0.01),主要涉及晚期糖基化产物-受体(AGE-RAGE)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路等.分子对接得分均小于-6.0.结论 初步揭示三七可从细胞、组织、器官、代谢、免疫、炎症、凋亡、氧化应激、离子通道等多方面治疗心房颤动,为后续进一步开展三七治疗心房颤动的作用机制和临床应用研究提供科学依据.
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