【摘 要】
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为了挖掘甘薯耐盐基因,利用不同盐胁迫时间甘薯根系的转录组数据,选取在样本间表达量变异最大的前50%基因(共32147个),进行加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)。结果表明,共构建了20个基因共表达模块,从中筛选出6个与甘薯盐胁迫相关的特异性基因共表达模块。其中,Green模块和Red模块与盐胁迫48 h正相关,Black模块和Yellow模块与盐胁迫12 h正相关;Midnightblue模块和Magenta模块与
【机 构】
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山西农业大学生命科学学院,山西农业大学农学院
【基金项目】
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国家重点研发专项(2018YFD1000705,2018YFD1000700),山西省农业科学院应用基础研究计划项目(YGC2019FZ4),中央引导地方科技发展资金项目,山西省自然科学基金项目(201801D121238),山西省重点研发项目(201803D221008-6),山西省新兴产业领军人才项目,山西省高等学校科技创新项目(2019L0388)。
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为了挖掘甘薯耐盐基因,利用不同盐胁迫时间甘薯根系的转录组数据,选取在样本间表达量变异最大的前50%基因(共32147个),进行加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)。结果表明,共构建了20个基因共表达模块,从中筛选出6个与甘薯盐胁迫相关的特异性基因共表达模块。其中,Green模块和Red模块与盐胁迫48 h正相关,Black模块和Yellow模块与盐胁迫12 h正相关;Midnightblue模块和Magenta模块与
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