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成本核算系统是按实用的成本分类、运行层次和医疗产出单位，建立不同层次、不同项目的目标成本计划制度，核算实际成本，以加强成本管理。建立医院成本核算体系必须以良好的财务管理系统和健全的医院信息系统为基础，各系统之间实现整合和信息共享，并能完整全面地采集到各种成本要素。本文就目前医院成本核算系统中的问题展开论述，指出医院现有成本核算体系下，成本核算过程中遇到的问题。