【摘 要】
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RNA-seq高通量测序广泛用于全基因组范围寻找新基因及剪接变体.根据RNA-seq数据的高通量及复杂度的特点,选择稳定、快速和准确的数据分析软件是必要的.Hisat2和MISO是免费开
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RNA-seq高通量测序广泛用于全基因组范围寻找新基因及剪接变体.根据RNA-seq数据的高通量及复杂度的特点,选择稳定、快速和准确的数据分析软件是必要的.Hisat2和MISO是免费开源软件,可分析高通量RNAseq测序数据剪接事件及其差异.本工作通过肝癌和对照组的比较确定了11 487个差异剪接事件,包括6 577个外显子跳跃事件,2 447个可变5’和可变3’事件,1 683个互斥外显子事件和780个内含子保留事件.差异剪接事件可注释到2 797个基因.疾病关联和KEGG疾病通路注释分析发现这些基因
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