【摘 要】
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利用生物信息学方法，从石榴（Punica granatum Linn.）品种‘突尼斯’（‘Tunisia’）基因组中鉴定自噬相关基因（ATG）家族成员，并对其蛋白质理化性质、染色体定位、基因结构、系统进化、共线关系和表达模式进行了分析。结果表明：从石榴基因组中共鉴定出58个ATG基因，定位在8条染色体上。58个石榴ATG家庭成员可分为6个亚族。58个石榴ATG基因中3对基因存在共线关系；石榴与拟南
【机 构】
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南京农业大学园艺学院江苏省果树品种改良与种苗繁育工程中心
【基金项目】
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江苏省自然科学基金面上项目（BK20201321）； 江苏省博士后科研资助计划项目（2020Z052）； 江苏省农业科技自主创新项目[CX（20）3016]； 江苏高校优势学科建设工程资助项目；
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利用生物信息学方法，从石榴（Punica granatum Linn.）品种‘突尼斯’（‘Tunisia’）基因组中鉴定自噬相关基因（ATG）家族成员，并对其蛋白质理化性质、染色体定位、基因结构、系统进化、共线关系和表达模式进行了分析。结果表明：从石榴基因组中共鉴定出58个ATG基因，定位在8条染色体上。58个石榴ATG家庭成员可分为6个亚族。58个石榴ATG基因中3对基因存在共线关系；石榴与拟南芥[Arabidopsis thaliana（Linn.） Heynh.]和葡萄（Vitis vinifera Linn.）ATG基因家族成员间分别存在45和41对共线关系。转录组数据挖掘显示：PgVTI12b-1、PgATG1b-1、PgATG8h-1、PgATG8c-2和PgATG8c-3 5个基因在ABA缓解干旱胁迫的响应中差异表达；NaCl胁迫下，石榴根和叶中分别有11和8个ATG基因差异表达，且PgATG6b、PgTORb和PgATG1b-2基因在根和叶中均差异表达。实时荧光定量PCR验证发现石榴ATG基因的表达模式与转录组结果基本一致。综合分析结果表明：PgVTI12b-1、PgATG1b-1、PgATG8h-1、PgATG8c-2和PgATG8c-3基因参与石榴叶对ABA缓解干旱胁迫的响应，而PgATG6b、PgTORb和PgATG1b-2基因则同时参与石榴根和叶对NaCl胁迫的响应。
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