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近年来多源数据融合成为蛋白质功能预测的一个热点,本文提出一种基于Choquet模糊积分的多源数据融合方法对酵母蛋白进行预测.文中采用支持向量机做基础分类器对各个数据源进行预测,输出概率形式的结果.使用粒子群算法确定模糊密度,基于Choquet模糊积分对每个数据源的结果进行融合.实验表明Choquet模糊积分蛋白质功能预测结果要明显优于传统的加权平均法、支持向量机方法和K近邻方法.