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参照立氏立克次体分子量为12×104蛋白基因序列合成引物，分两段扩增日本立克次体的12×104蛋白基因，扩增DNA的长度分别为2.5和2.6kb。含有启动子区的2.6kb片段在pUC19质粒中不稳定。从这段DNA删去启动子及85个氨基酸编码子区的扩增产物可被克隆。以这一重组质粒为载体克隆含终止密码子的2.5kb片段。序列分析表明开放阅读框架由4956核苷酸对组成，编码1652个氨基酸。日本立克次体与立氏立克次体ompB基因的遗传同源性是95.5%，表明分子量12×104可能被用于制备抗斑点热立克次体感染的亚单位疫苗。