基于肽序列标签的蛋白质翻译后修饰中的过滤算法

来源 :计算机应用 | 被引量 : 1次 | 上传用户:dillon100200
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大量的质谱数据无法被鉴定或是鉴定的精度不够高,特别是在肽段数据库较大时,普通的算法精度下降很快。提出一种新的盲搜索算法,此算法基于一种全新的基于相似关系度量的打分模型。为了处理大规模问题,同时还应用了基于母离子质量和肽序列标签的前过滤方法,使得此算法在较大规模的数据库上精度得到很好的保证。实验结果表明,对于规模为10000,20000,50000的肽段数据库,其鉴定准确率分别为78.3%,74.2%,65.5%。随着数据库规模的增大,算法的鉴定准确率保持得较好。
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