“十三五”时期，随着生态文明改革持续深入，水环境治理已转变为精准治污、科学治污，效果显著。以重庆市“十三五”国家考核断面地表水环境质量评价为实例，基于时空多尺度的概念，提出了“多尺度综合评价”研究地表水环境质量时空演化的方法，以时间尺度上年度和年内地表水环境质量、主要污染物变化规律为出发点，进行空间尺度上由点（出入境断面）到线（长江干流）再到面（全市地表水）的综合分析。结果表明：“十三五”时期重庆市国家考核断面地表水环境质量逐年呈阶梯式改善，年内水质变化总体呈现下半年水质优于上半年的规律；主要污染物浓度夏季明显增高，地表水环境污染主要为农业面源污染造成；全域范围内水质优良情况与经济发展水平呈负相关，东部区域水质明显优于西部区域；氮、磷防控效果显著，消减率为30.89%和10.45%。该成果对评价“十三五”以来的污染防治效果具有实际意义，也可为“十四五”开展相关污染治理提供理论依据。