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对转基因鱼试验湖7个采样点的浮游生物群落进行了PCR—DGGE指纹分析,并进而探讨了DNA指纹与理化因子的关系。结果表明:(1)PCR—DGGE指纹图谱中共含104谱带,其中原核谱带58条,真核谱带46条,其多态性位点分别为87.9%和82.6%。(2)各站点的理化因子中,Ⅰ站的TP含量最高(0.10mg/L),TN含量在Ⅲ站最高(0.34mg/L),且各站点波动较大,Ⅴ站的透明度最低(63.00cm);NO3-N、NH4-N、pH、DO、COD及电导率在各站点变化不大。基于原核生物图谱的相似性聚类分析表