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描述了依据本发明一实施例的转录作图方法，该方法综合了基于短标签测序方法（SAGE和MPSS）的效率和全长eDNA（ficDNA）方法的精确性来全面描述转录组。这个方法也称为基因识别标签分析（GIS）方法。在该方法中，截取全长cDNA克隆的5’和3’末端来连接形成一个双标签结构，随后以一种高效方式对该双标签的双标签串联体进行测序，最后定位到基因组中来确认该基因的结构。由于一个GIS双标签代表一个转录本的5’和3’末端，所以它提供的信息量比SAGE和MPSS标签的更多。为了能够有效的进行转录作图和基因定位识别