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以兰科的石斛属、石仙桃属、石豆兰属等14属matK全长CDS为研究对象,通过比较属内、属间序列两两p-距离,得到属内p-距离上限和属间p-距离下限,并以石斛属、石豆兰属和石仙桃属3个近缘属的matK部分CDS为待检序列进行实地鉴定.结果表明,基于matK可清楚地将石斛属、石仙桃属、石豆兰属序列鉴定到其对映的属,表明基于matK序列可将中药石斛鉴定到属.