多发性硬化（MS）的一个重要的临床表现是认知障碍。有越来越多的证据显示，认知障碍的程度不仅与组织损坏程度有关，还同MS患者组织受损、组织修复及大脑皮层重组等因素间复杂的制约平衡关系密切相关。神经可塑性能够在大脑中散乱分布多个病灶的情况下使得大脑维持正常运行，而功能磁共振成像（fMRI）及静息态fMRI能够为我们提供有关神经可塑性程度及性质的信息。MS患者除了临床表型之外，在对他们的视觉、认知及运动系统进行研究的过程中，还发现其大脑执行某项任务的区域发生了改变，或者使用了正常人脑在执行该任务时不会使用的区域。这些功能性改变与传统MRI中T2像可见病灶内及其周边的脑损伤范围及其严重程度，以及中枢神经系统(CNS)某些结构，包括脊髓及视神经的参与有关。脑功能异常不仅在急性复发之后，而且在病情稳定期也在随时间而不断变化。本文对任务fMRI及静息态fMRI在MS诊疗中的作用，fMRI技术的研究成果及其临床应用现状进行了总结，并对其未来发展方向进行展望。