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子宫内膜异位症的发生，以免疫系统不能排斥异位植入的自体子宫内膜细胞为前提；通常伴有机体免疫活性细胞的功能变化，自身抗体产生，以及子宫内膜细胞本身生物学行为的变化。传统的内分泌治疗方法可以改善病变，但对子宫内膜异位有关的不育的治疗。对于需要避孕的子宫内膜异位症患者，可以使用不含雌激素的避孕药，或阴道内的避孕方法。