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瑞金市乡镇卫生在旧财政体制(即市对乡镇实行超收全留、欠收自补、定额补助的分税制财政体制)的影响下,一直存在着在职人员工资及离退休人员生活费发放不足的问题.乡镇卫生虽说属差额拨款事业单位,但各乡镇财政对卫生的差额补助微乎其微.据调查,2002年瑞金市各乡镇财政对乡镇卫生的投入仅16.78万元,2003年也只有17.78万元(含"非典"期间专项投入7.03万元).