【摘 要】
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目的 通过生物信息学方法分析结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb) pepA蛋白的结构和功能.方法 采用Protparam、ProtScaleon Expasy、TMHMM、SingalP5.0、PSORT、N
【机 构】
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重庆医科大学病原生物学教研室,重庆400016
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目的 通过生物信息学方法分析结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb) pepA蛋白的结构和功能.方法 采用Protparam、ProtScaleon Expasy、TMHMM、SingalP5.0、PSORT、NetPHOS3.1、BLAST、SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred、SYFPEITHI等生物信息学软件分析Mtb H37Rv菌株pepA蛋白的生物学特性. 结果 pepA蛋白的编码基因Rv0125全长1 068 bp,该蛋白由355个氨基酸组成,等电点5.04,为疏水性蛋白,有1个的信号肽和1个丝氨酸蛋白酶结构域,含有19个磷酸丝氨酸位点;蛋白二级结构中无规则卷曲占44.79％,为稳定蛋白;该蛋白预测含多个B细胞和T细胞表位,其中MHC-Ⅰ型和MHC-Ⅱ型表位集中在蛋白N端的前60个氨基酸区域. 结论 该蛋白预测含多个B细胞和T细胞表位,其中MHC-Ⅰ型和MHC-Ⅱ型表位集中在蛋白N端的前60个氨基酸区域,该区域可激活Mtb特异性CTL和Th免疫应答,可作为抗结核肽疫苗的候选.
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