【摘 要】
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miRNA是一类长度约22 bp的小分子非编码RNA,在骨骼肌生长和肌细胞分化过程中起着重要的调控作用。利用Solexa测序技术对3只84日龄成年公兔的腿肌进行了miRNA测序,旨在评估高
【机 构】
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四川省畜牧科学研究院/动物遗传育种四川省重点实验室;
【基金项目】
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农业部国家现代农业产业技术体系项目(CARS-43-D-3);四川省畜牧科学研究院基本科研业务专项资金项目(2016YSKY0142);四川省应用基础研究项目(2017JY0079)
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miRNA是一类长度约22 bp的小分子非编码RNA,在骨骼肌生长和肌细胞分化过程中起着重要的调控作用。利用Solexa测序技术对3只84日龄成年公兔的腿肌进行了miRNA测序,旨在评估高通量测序在发掘家兔miRNA中的数据质量以及解析家兔肌肉组织中miRNA的生物学特征。结果表明,除前4位碱基的错误率略高于0.5%外,其他位置的碱基错误率均低于0.5%,说明测序质量好、可信度高,获得的序列可用于后续miRNA的鉴定分析。纯净序列中其他类型RNA的比例仅占2.07%。肉兔肌肉中18~24 nt的小RNA首位碱基以U为主,其次为碱基A,具有很强的偏向性。miRNA序列长度主要分布在20~24 nt范围内,占纯净序列的90%以上。miRNA长度分布的不平衡和首位碱基的偏向性可能与miRNA的作用机理和具体生物学功能有关。
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