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沙眼衣原体（Ct）是生殖道性传播疾病流行最为广泛的病原体，可引起一系列并发症，如盆腔炎、不育、宫外孕等。在俄罗斯女性中生殖道Ct感染约为6％。诊断该感染的方法常用核酸扩增试验，包括聚合酶链反应（PCR）、连接酶链反应（LCR）和转录扩增方法。这些方法比直接免疫荧光染色和酶免疫法的敏感和特异。衣原体培养方法复杂，很少用。但核酸扩增试验的敏感性还存在一些问题，包括临床标本中的激素、血红蛋白、有机盐、免疫球蛋白和细胞代谢的其他产物的抑制，以及在提取时核酸的丢失。