金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的致病菌，自20世纪40年代青霉素问世后，金黄色葡萄球菌引起的感染性疾病受到较大的控制。但随着人们对青霉素的广泛使用，有些金黄色葡萄球菌产生青霉素酶，能水解β-内酰胺环，表现为对青霉素的耐药。人们又研究出一种新的能耐青霉素酶的半合成青霉素，即甲氧西林［1］。1959年甲氧西林应用于临床后，曾有效控制了金黄色葡萄球菌产酶株的感染。但时隔2年，英国首次发现了耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（methicillin-resistant staphylococcus aureus ，M RSA ）［2］。 M RSA 感染几乎遍及全球，现已成为院内感染的重要病原菌之一，其菌株的分型及同源性分析是控制该耐药菌医院感染的重要环节。目前，医院感染中常用的细菌分型法有表型和基因型2大类，血清型、噬菌体分型、抗菌谱型等传统的分型方法均属于表型法。由于表型涉及基因产物（而不是全部基因）的表达，加之细菌易受环境因素影响，很易改变其表达性状，因而表型分型分辨率低，现已少用；另一类是基因分型法，近年来基因分型技术广泛应用于M RS A的分型研究，为M RS A的分型提供了有用的工具。以下介绍几种常用的基因分型方法。