【摘 要】
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通过生物信息学方法筛选肝癌关键致病基因,探究其表达水平、致病机制、免疫浸润、突变及预后情况,并进一步挖掘潜在的可用于肝癌靶向治疗的中药。通过数据集GSE19665分析正常和肝癌组织的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs);对DEGs进行GO和KEGG分析,构建DEGs蛋白互作网络并筛选肝癌发病关键基因;对关键基因进行突变、免疫浸润、表达及预后分析;
【机 构】
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湖南中医药大学中医诊断学湖南省重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金(81703920,82004427); 湖湘青年科技创新人才项目(2021RC3101); 湖南省教育厅科学研究重点项目(21A0240);
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通过生物信息学方法筛选肝癌关键致病基因,探究其表达水平、致病机制、免疫浸润、突变及预后情况,并进一步挖掘潜在的可用于肝癌靶向治疗的中药。通过数据集GSE19665分析正常和肝癌组织的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs);对DEGs进行GO和KEGG分析,构建DEGs蛋白互作网络并筛选肝癌发病关键基因;对关键基因进行突变、免疫浸润、表达及预后分析;挖掘潜在的治疗肝癌的中药和天然活性成分。筛选得到显著性DEGs 159个,主要涉及免疫、炎症反应,参与p53、mTOR等信号通路;筛选出10个关键基因,CDC20等四个基因在肝癌组织的表达显著升高,高表达组患者的总生存期明显降低;关键基因突变患者的总生存期和无病生存期均明显降低;关键基因表达与免疫细胞浸润密切相关;以关键基因为靶点筛选得到36种中药和105种中药活性成分。本研究鉴定出了肝癌关键致病基因,其异常表达与肝癌的不良预后、免疫细胞浸润密切相关,挖掘出潜在的治疗肝癌的中药及其活性成分,研究结果可为肝癌的诊断、治疗及预后提供科学依据。
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