【摘 要】
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目的基于生物信息学分析方法,获取与正常肝组织具有表达差异、且与肝癌患者生存、病理参数密切相关的肝癌基因。方法通过GEO数据库获取三组肝癌芯片表达谱,利用GEO2R鉴定肝癌
【机 构】
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日照心脏病医院,西安交通大学附属儿童医院
【基金项目】
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陕西省社会发展科技攻关项目(NO.2016SF-036),西安交通大学基本科研业务费自由探索与创新-教师类项目(NO.XZY012019129)
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目的基于生物信息学分析方法,获取与正常肝组织具有表达差异、且与肝癌患者生存、病理参数密切相关的肝癌基因。方法通过GEO数据库获取三组肝癌芯片表达谱,利用GEO2R鉴定肝癌组织与正常肝组织具有表达差异的基因;应用DAVID数据库,富集差异表达基因;使用STRING数据库及Scytoscape软件,构建核心差异基因的蛋白质互作网络(protein-protein interaction,PPI),并通过UCSC Cancer Genomics Browser网站在TCGA数据库中验证关键差异基因在肝癌中的表达
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