【摘 要】
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为研究猪嵴病毒VP1蛋白的结构与功能,运用RT-PCR技术扩增猪嵴病毒VP1基因,测序并对其进行生物信息学分析。结果显示,成功获得了762bp的猪嵴病毒VP1基因(GenBank登录号为JX294
【机 构】
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四川农业大学动物生物技术中心; 动物疫病与人类健康四川省重点实验室;
【基金项目】
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四川省科技支撑计划项目(2012NZ0001)
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为研究猪嵴病毒VP1蛋白的结构与功能,运用RT-PCR技术扩增猪嵴病毒VP1基因,测序并对其进行生物信息学分析。结果显示,成功获得了762bp的猪嵴病毒VP1基因(GenBank登录号为JX294863)。经生物信息学分析,此序列编码253个氨基酸,理论等电点(pI)为4.81,理论分子质量为26 879.2u,不稳定系数为35.93;在同一氨基酸的不同密码子的选择上存在一定的偏向性;最大疏水指数为1.967,最小疏水指数为-2.244;无信号肽和跨膜区;N末端和C末端抗原指数较高,预测抗原表位位于这些区域;蛋白核心结构为8个β折叠片围成一个柱状结构;进化树分析结果显示,JX294863与匈牙利株在一个分支上,两者亲缘关系较近。
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