基于高通量测序的中国水仙根际土壤微生物群落组成

来源 :福建农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：Fijy520

【摘要】

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摘要：【目的】明確中同水仙植株根际土壤微生物群落的组成特征。【方法】采用Illumina Miseq高通量测序技术对水仙根际土壤微生物样品的保守基因区进行测序及生物信息学分析，阐明中同水仙根际土壤的细菌、真菌和^菌群落结构组成，并对水仙根际土壤微生物的优势菌属进行深入分析。【结果】共获得优化序列175840条，基于97%序列相似度，聚类为2 680个OTUs。优势细菌类群是绿弯菌门Chlorofl

【作者】

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李媛媛张琼陈小煌张敬虎陆銮眉

【机构】

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闽南师范大学生物科学与技术学院/闽台特色园林植物福建省高等学校重点实验室,闽南师范大学化学化工与环境学院

【出处】

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福建农业学报

【发表日期】

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2021年8期

【关键词】

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中国水仙根际土壤微生物高通量测序细菌真菌古菌

【基金项目】

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福建省科技计划对外合作重点项目(2018I0014),漳州市自然科学基金项目(ZZ2020J10),漳州市科技重大专项(ZZ2019ZD01),闽南师范大学校长基金项目(4206/L21918)。

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【目的】明确中国水仙植株根际土壤微生物群落的组成特征。【方法】采用Illumina Miseq高通量测序技术对水仙根际土壤微生物样品的保守基因区进行测序及生物信息学分析,阐明中国水仙根际土壤的细菌、真菌和古菌群落结构组成,并对水仙根际土壤微生物的优势菌属进行深入分析。【结果】共获得优化序列175840条,基于97%序列相似度,聚类为2680个OTUs。优势细菌类群是绿弯菌门Chloroflexi(30.86%)和变形菌门Proteobacteria(20.67%),真菌以子囊菌门Ascomycota(84

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