【摘 要】
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目的与方法:为阐明已报道的5种水母溶血毒素的氨基酸组成和序列、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、二级结构、保守区域、分子进化关系等,利用生物信息学方法对其进行了分
【机 构】
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第二军医大学研究生管理大队学员11队; 第二军医大学海医系防化医学教研室;
【基金项目】
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上海市自然科学基金(No.06ZR14111);全军“十一五”专项(No.06Z020)~~
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目的与方法:为阐明已报道的5种水母溶血毒素的氨基酸组成和序列、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、二级结构、保守区域、分子进化关系等,利用生物信息学方法对其进行了分析和预测。结果与结论:不同水母溶血毒素的氨基酸组成和理化性质相类似;水母溶血毒素存在跨膜结构域和疏水区域;在20～21位点最有可能存在信号肽切割位点;α螺旋、不规则卷曲是二级结构中最大量的结构元件,β折叠散布于整个蛋白质中;在其中3种水母毒素蛋白中存在4个保守区;以MP法和NJ法构建的系统发生树基本一致。
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