【摘 要】
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从野生禽类鹧鸪的喉气管拭子中分离到1株冠状病毒,命名为Partridge／GD／S14／2003 (简写为S14)．通过RT-PCR扩增、克隆测序获得了该毒株的全基因组序列(AY646283),序列经 DNAstar分
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(批准号:39893290)
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从野生禽类鹧鸪的喉气管拭子中分离到1株冠状病毒,命名为Partridge／GD／S14／2003 (简写为S14)．通过RT-PCR扩增、克隆测序获得了该毒株的全基因组序列(AY646283),序列经 DNAstar分析发现,S14毒株与肾型毒株JX1-99,TJ2-96 S1基因同源性最高,分别达到94．6％和93．4％,并且该毒株的s1基因还和QXIBV,LX4株也存在高度亲缘性,分别达到85％和 84．3％,同时对S14 S1基因BLAST时发现只有上述毒株和S14有高度同源．由此推测该鹧鸪分离株S14的进化可能与IBV肾型和腺胃型病毒存在一定关系．序列分析表明,S14毒株与Gen Bank中注册序列QXIBV,LX4的S2基因同源性最高分别达到97．2％和90．6％,都处于Ⅱ群．M 基因系统进化树研究发现,S14处于Ⅲ群,与SAIB20,GD6-98同源性最高,分别达到90．6％和 90．2％;而与其S1,S2基因同源较高的BJ,QXIBV株,M基因的进化关系却较远．N基因同源性和系统进化树分析发现,Ⅰ群毒株可能为H52和Gray株发生重组的结果,Ⅱ群毒株可能为 H120和D1466等毒株重组的结果,而S14株处于Ⅲ群,其N基因与QXIBV高度同源,达到 95．7％,Ⅳ群为肾型分离株．而与其M基因亲缘性最近的SAIB20,GD6-98则分处Ⅰ,Ⅳ进化群．
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