【摘 要】
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为了解内蒙古地区绵羊梅迪-维斯纳病毒(MVV)的分子结构特征和遗传变异情况,本研究利用Illumina Hiseq 4000二代测序技术对MVV阳性绵羊病肺组织进行病毒全基因组测定,并对全基因组特征、gag和env及其编码的氨基酸序列进行系统进化分析.结果 显示,获得全长9193 bp的MVV全基因组序列,命名为NM1111,并上传GenBank获得基因登录号MW248464;全基因组、gag和env核苷酸序列与参考株的相应核苷酸序列的同源性分别为75.8％～81.4％、77.1％～86.8％和67.7％
【机 构】
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内蒙古农业大学兽医学院,内蒙古呼和浩特010018;农业部动物临床诊疗技术重点实验室,内蒙古呼和浩特010018;内蒙古自治区基础兽医学重点实验室,内蒙古呼和浩特010018;北京农业职业学院,北京1
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为了解内蒙古地区绵羊梅迪-维斯纳病毒(MVV)的分子结构特征和遗传变异情况,本研究利用Illumina Hiseq 4000二代测序技术对MVV阳性绵羊病肺组织进行病毒全基因组测定,并对全基因组特征、gag和env及其编码的氨基酸序列进行系统进化分析.结果 显示,获得全长9193 bp的MVV全基因组序列,命名为NM1111,并上传GenBank获得基因登录号MW248464;全基因组、gag和env核苷酸序列与参考株的相应核苷酸序列的同源性分别为75.8％～81.4％、77.1％～86.8％和67.7％～75.5％;基于gag序列的系统进化分析,NM1111与A2型MVV聚为一支,属于A2型;Gag蛋白的主要同源区(MHR)存在D296E的突变,Env蛋白变异程度较大,表面蛋白V4区存在氨基酸插入,SU5抗原表位在氨基端有一个完全保守的基序(VRAYTYGV),在羧基端有一个高度可变的基序.本研究提供了中国地区首个绵羊MVV完整序列,为中国地区MVV分子生物学特性研究提供基础参考.
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