【摘 要】
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目的利用生物信息学方法进一步认识肝癌细胞应对肿瘤坏死因子α(TNF–α)刺激过程中的细胞黏附相关的信号转导网络。方法利用肝癌细胞HepG2应对TNF–α刺激的基因芯片数据、转录因子数据库HTRI以及蛋白–蛋白相互作用数据库HRPD构建了肝癌细胞应对TNF–α刺激过程中的信号转导网络,并利用网络结构和基因功能聚类的分析方法进行了研究。结果发现在信号转导网络中MYC、SP1等基因是信号转导网络中的关键
【机 构】
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100730 中国医学科学院 北京协和医学院 北京协和医院肝脏外科,100730 中国医学科学院 北京协和医学院 北京协和医院肝脏外科,100730 中国医学科学院 北京协和医学院 北京协和医院肝脏外
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目的利用生物信息学方法进一步认识肝癌细胞应对肿瘤坏死因子α(TNF–α)刺激过程中的细胞黏附相关的信号转导网络。
方法利用肝癌细胞HepG2应对TNF–α刺激的基因芯片数据、转录因子数据库HTRI以及蛋白–蛋白相互作用数据库HRPD构建了肝癌细胞应对TNF–α刺激过程中的信号转导网络,并利用网络结构和基因功能聚类的分析方法进行了研究。
结果发现在信号转导网络中MYC、SP1等基因是信号转导网络中的关键转录因子,信号转导网络中的基因与细胞黏附密切相关,EGFR很可能是肝癌细胞应对TNF–α刺激过程中调控细胞黏附的关键基因。
结论EGFR很可能在TNF–α引起的肝癌细胞迁移过程中发挥了关键作用。
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