目的建立反义寡核苷酸药物CT102的离子交换色谱含量测定方法。方法对不完全硫代序列杂质5’(P=O)、3’(P=O)与CT102全长序列的分离情况进行了考察,采用DNA Pac PA-100阴离子交换柱(4 mm×250 mm);流动相A为1mmol/L乙二胺四乙酸(EDTA)二钠/25 mmol/L三羟基氨基甲烷(Tris),5%乙腈(V/V);流动相B为1 mmol/LEDTA二钠/25mmol/L Tris/1.5 mol/L溴化钠,5%乙腈(V/V);洗脱梯度为0～15 min,40%B～100%B;柱温50℃;流速为1 ml/min;检测波长260 nm。结果合成过程中产生的主要杂质不完全硫代序列(P=O)能够实现与CT102全长序列的分离,CT102在75～1200μg/ml范围内呈良好的线性关系,r2=0.9999,仪器精密度良好,日内精密度RSD为0.64%,日间精密度RSD值为1.19%,检测限为5μg/ml,最低定量限为15μg/ml。结论该方法准确可靠,体系稳定,经济简便,不完全硫代杂质与主峰分离良好,可用于CT102原料药的含量测定,也为规模化制备和终产品的质量控制提供可靠保障。