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目的 探讨食管癌/贲门癌高发区人群食管癌和贲门癌染色体基因组变化特征.方法应用比较基因组杂交技术分析37例原发性食管癌和30例贲门癌患者染色体基因组的变化.结果比较基因组杂交发现,食管癌组织染色体8q发生DNA扩增的频率最高(78%),其它依次为3q、5p、6q和7p;3p发生DNA丢失的频率最高(57%),其它依次为8p、9q和11q.贲门癌组织染色体20q发生DNA扩增频率最高(43%),其它依次为6q、8q和6p; 17p发生DNA丢失的频率最高(57%),其它依次为19p、1p和4p.结论 8q、3q和5p DNA扩增和3p、8p和9q DNA丢失是河南高发区食管癌患者基因组DNA变化特征;而20q、6q DNA扩增和17p、19p、1p DNA丢失可能是河南高发区贲门癌患者基因组DNA变化特征. 这些结果为进一步定位筛选和克隆与食管癌/贲门癌相关基因提供了重要的理论信息。