【摘 要】
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为了深入探究江西铅山红芽芋TIFY 9基因的功能,通过江西铅山红芽芋试管苗转录组数据库筛选到江西铅山红芽芋TIFY 9基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆该基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位、器官表达分析和功能分析.结果表明:江西铅山红芽芋TIFY 9基因cDNA总长度为522 bp,G+C含量为58.62％;由174个氨基酸组成,分子量19073.87 u,等电点9.30,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(31.61％)、β-片层(12.64％)、无规
【机 构】
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上饶师范学院生命科学学院,江西上饶334001;上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室,江西上饶334001;上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室,江西上饶334001;上饶农业技术创新研究院
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为了深入探究江西铅山红芽芋TIFY 9基因的功能,通过江西铅山红芽芋试管苗转录组数据库筛选到江西铅山红芽芋TIFY 9基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆该基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位、器官表达分析和功能分析.结果表明:江西铅山红芽芋TIFY 9基因cDNA总长度为522 bp,G+C含量为58.62％;由174个氨基酸组成,分子量19073.87 u,等电点9.30,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(31.61％)、β-片层(12.64％)、无规则卷曲(55.75％)构成,三级结构为单体;主要存在细胞核中;在进化上与Colocasia esculenta(芋)的亲缘关系较近,与Colocasia esculenta(芋)hypothetical protein Taro_030839(MQL98131.1)在进化上具有最高的亲缘关系.江西铅山红芽芋TIFY 9蛋白具有典型植物TIFY 9的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种同源性高达100％,在进化上高度保守.烟草叶片亚细胞定位分析表明,TIFY 9定位于细胞质和细胞核中.实时定量PCR结果显示,TIFY 9基因在江西铅山红芽芋中的表达存在器官特异性,在江西铅山红芽芋不同组织部位均有表达,且在叶中和球茎膨大初期表达量最高.在烟草花叶病毒胁迫下,与TIFY 9非转基因烟草相比较,TIFY 9转基因烟草的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)、最大光化学效率(Fv/Fm)、实际光化学量子效率(ΦPSⅡ)、光化学淬灭系数(qP)及电子传递效率(ETR)显著增加,而非光化学淬灭系数(NPQ)显著下降,表明TIFY 9基因响应病毒胁迫应答可能是依赖光合作用的提高.
其他文献
以涪陵茎瘤芥为例,基于历史丰歉气象影响指数,综合诊断筛选气象要素相似年型,采用大概率法与加权平均分析法建立茎瘤芥产量预报模型,并验证不同方法的茎瘤芥产量动态预报准确性.结果表明:同一年份不同起报时间的气象条件相似年型差异主要发生在热量条件的相似年,其次是光照条件相似年,而水分条件相似年在同一年份不同起报时间无变化.但同一起报时间不同年份的气象条件相似年,无明显的重复性,即年际间的气象条件具有差异性,能够综合反映气象条件对茎瘤芥产量丰歉的决定性.比较大概率法与加权平均分析法的茎瘤芥产量预报结果,在产量丰歉趋
本试验旨在研究Zn-Pal对犬肠道菌群和血清免疫、抗氧化能力的影响.将20只9月龄比格犬随机分成4组,每组5只,分别饲喂基础日粮+ZnSO4(锌添加水平为80 mg/kg,对照组)、基础日粮+2.55 g/kg Zn-Pal(锌添加水平为60 mg/kg,Zn-Pal-60)、基础日粮+3.42 g/kg Zn-Pal(锌添加水平为80 mg/kg,Zn-Pal-80)、基础日粮+4.30 g/kg Zn-Pal(锌添加水平为100 mg/kg,Zn-Pal-100)o 30 d后对各组犬只肠道主要菌群和
为了解miR169基因家族在辣椒生长发育过程的重要调控作用,通过生物信息学的方法对can-miR169基因家族的成员进行了染色体定位、序列保守性分析、系统发育进化树分析、前体序列二级结构预测和靶基因预测.结果表明:can-miR169家族成员定位在4条染色体上;成熟序列高度保守,前体序列在产生成熟序列的位置高度保守;预测结果显示can-miR169家族成员均有靶基因,这些靶基因主要以靶基因核因子A(NF-YA)复合物为主,且大体相同.这些靶基因可以参与到种子萌发、植株发育和对外界环境胁迫的应答等多种生命活
采用羧基荧光素(FAM)和六氯荧光素(HEX)荧光基团标记探针,建立针对农作物中常见抗虫和抗除草剂基因的双重实时荧光PCR检测方法,通过特异性、检出限以及模拟掺假试验验证此方法在转基因检测中的适用性.特异性检测试验中仅转基因作物(转基因棉花、转基因水稻、转基因大豆)和阳性质粒检测出相应转基因成分,其余样品均未出现明显PCR扩增曲线;检出限结果表明,双重实时荧光PCR方法对Cry1A(c)、CP4-EPSPS基因的检出限分别为1、0.1 ng,所建立的标准曲线r2值均大于0.98,具有对农作物中的转基因成分
为了能够精准地识别出暗纹东方鲀胚胎发育的各个时期,提高人工繁殖和杂交育种的成活率,采用暗通道先验(DCP)算法和它的2个反演以及推导,对胚胎图像进行增强.推导出4种透射率,再结合像素值的缩小和放大最终生成8种增强效果.其中图像增亮与图像增暗结合的A+X组合算法效果最佳,增强后的图像细节信息更加丰富,各个时期的特征更加清晰.选用多目标检测算法YOLOv5网络对图像中的胚胎进行提取和分类.结果表明,增强后图像分类结果的准确率比原始图像提高4.5％,损失函数降低0.16％.
近年来,中国家兔养殖业规模化、集约化程度越来越高,粪污尤其是污液的处理已成为制约家兔养殖业可持续发展的重要因素.本研究采用异位发酵技术处理兔场污液,通过测定垫料理化特性,评价应用效果.结果表明,发酵床在停止添加污液后再持续发酵22 d,垫料中有机质、全氮、五氧化二磷、氧化钾含量,砷、铬、铅、汞及镉的含量均符合《畜禽粪便堆肥技术规范》(NY/T 3442-2019)对堆肥产物质量的要求.异位发酵与氧化塘处理相比,污液在集污池内存储时间缩短为21～28 d,周转时间(21～28 d)远低于氧化塘法所需的90
希金斯炭疽菌是一种半活体营养型植物炭疽病原真菌,能够侵染多种十字花科植物引起的炭疽病,特别是引起蔬菜炭疽病的重要病原.胞吞在真菌侵染植物过程中发挥着重要作用,该作用一般同具有NPFxD基序的蛋白受体介导有关,然而,目前有关该炭疽菌中胞吞作用相关蛋白尚未明确.基于前人已报道的构巢曲霉中NPFxD蛋白序列,通过关键词搜索以及Blastp比对等方法对希金斯炭疽菌蛋白质数据库进行NPFxD蛋白找寻,明确该菌中存在2个NPFxD蛋白序列,根据蛋白同源性,分别命名为ChMYO1、ChGBP2.同时,对这2个蛋白序列开
高粱炭疽病是威胁高粱生长的主要病害之一,挖掘高粱抗炭疽病相关基因能够为高粱抗性品种育种打下基础.利用前期田间试验鉴定出的高粱高抗材料F41和高感材料B57进行杂交构建F2:3代分离群体,挑选高梁高抗炭疽病植株和高感炭疽病植株各30株,分别构建2个极端性状的DNA混合池,利用高通量测序技术与集团分离分析法相结合的方法(BSA-seq)进行全基因组重测序和关联分析,定位和抗性性状相关的基因组区段.通过SNP-index及InDel-index方法进行关联分析及对候选区域进行基因注释,共注释到基因143个,其中
采用田间试验,以9年生中梨1号梨树为试材,连续2年以常规施肥枪施肥为对照,以3种水溶肥35-10-7、17-17-16-TE和18-9-24-TE分别在采后、幼果期和膨大期以组合“套餐”形式,通过水肥一体化滴灌方式施肥.探讨水肥一体化滴灌施肥方式下梨树水溶肥组合对树体生长、果实产量及品质的影响,为梨树减肥提质增效提供科学的施肥依据.结果表明:1)2种施肥方式下各生育期内大、中量元素含量基本表现为短梢叶高于长梢叶,处理间无显著差异;微量元素Fe、Cu、B含量均表现为滴灌施肥方式下较高.2)果实中的N、P、K
类胡萝卜素是番茄呈现不同色泽的物质基础,系统研究番茄色泽与类胡萝卜素种类、含量的相关性可以为筛选特定类胡萝卜素成分如六氢番茄红素、八氢番茄红素和顺式番茄红素等提供指导.利用高效液相色谱-二极管阵列检测系统(HPLC-PDA)和色度仪对12个不同品种番茄在不同成熟期的类胡萝卜素组成和颜色特征值进行分析.结果表明,红色系番茄主要积累番茄红素,最高鲜质量含量达到(123.50±1.34)μg/g;黄色系番茄、绿色系番茄主要积累β-胡萝卜素,最高鲜质量含量达到(7.56±0.02)μg/g.黄色系番茄中橙色番茄有