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针对基于网络化简和保护配合关系的最小断点集（MBPS）计算方法所出现的多组同基MBPS问题，提出了一种基于保护三类矩阵（即保护重要度矩阵、保护归属矩阵、保护关联矩阵）和网络化简的MBPS求取方法，并以保护归属矩阵来解决网络的平行线路判据问题。该方法先形成保护三类矩阵，再以化简步骤对其进行动态调整，并按照断点选取原则选取断点，能够获取最优MBPS。最后通过算例验证了该算法的可行性和有效性。