【摘 要】
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目的:基于网络药理学和生物信息学方法探讨枸杞子-丹参(LFSMR)药对治疗视网膜色素变性(RP)的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选和预测LFSMR药对
【机 构】
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湖南中医药大学中医诊断研究所; 湖南中医药大学中医学院; 湖南中医药大学中医药防治眼耳鼻咽喉疾病湖南省重点实验室; 湖南中医药大学第一附属医院;
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(81804150,81703920);国家中医药管理局中医眼科学重点学科建设项目(ZK1801YK015);湖南省教育厅创新平台开放基金项项目(16K065);中医药防治五官科疾病湖南省重点实验室建设项目(2017TP1018);长沙市科技计划项目(kc1704005);湖南省中医药管理局科研项目(201780);湖南中医药大学中医诊断学国家重点学科开放基金(2015ZY
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目的:基于网络药理学和生物信息学方法探讨枸杞子-丹参(LFSMR)药对治疗视网膜色素变性(RP)的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选和预测LFSMR药对可能的入血活性成分和作用靶点;通过疾病基因数据库挖掘视网膜色素变性相关的基因靶点;采用功能蛋白联合网络数据库(STRING)绘制成分-靶点和疾病-靶点的蛋白质-蛋白质交互作用(PPI)网络,并取这两个网络的交集;运用DAVID对交集网络进行基因本体和KEGG通路分析;采用cytoHubba分析筛选关键靶点。结果:在TCMSP数据库共检索出与LFSMR相关的活性成分390个,根据药代动力学参数筛得活性成分110个,进一步筛选获得19个入血活性成分,并检索出与这些成分相关的靶点208个;从疾病基因数据库获得与RP直接相关的基因206个;成分靶点和疾病靶点PPI网络取交集后得到79个基因;这些基因主要涉及蛋白自体磷酸化、转录调节、细胞增殖等生物学过程,分子功能主要涉及三磷酸腺苷结合、转录因子活性、核心启动子结合等,富集于核质、转录因子复合物、细胞核、细胞质等区域,主要与神经营养素信号通路、细胞周期相关通路、Wnt信号通路有关;进一步分析筛选得到LFSMR治疗RP的8个关键性基因靶点。结论:LFSMR药效作用的物质基础为多孔甾醇、丹参酮IIA等19个入血活性成分,其治疗RP的关键靶点包括E2F1、RB1等8个基因,主要作用机制与调控神经营养素信号通路、细胞周期相关通路等信号网络有关。
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