探索中国不同质量发展地区企业绿色创新效率差异及损失来源,有利于提高绿色创新水平以促进工业企业高质量发展.传统研究忽略了不同质量发展地区企业之间的技术差距,使得绿色创新效率评价标准单一且结果失准,无法确定效率损失的真实原因.本文基于高质量发展视域下绿色创新共同前沿理论,将中国工业企业分为高质量、中质量和低质量发展企业三个群组,构建包含非期望产出的共同前沿-SBM-DEA模型测算分析2008～2017年中国企业两阶段绿色创新效率,分析三大群组之间的技术差距及其变化趋势;将创新无效率值分解为技术差距无效(TGRI)和管理无效(MI),寻找不同质量发展企业创新效率损失的主要来源;最后,从群组创新环境和企业内部管理两方面分析和检验了影响TGRI和MI的关键因素.研究结果表明:①共同前沿下中国企业绿色研发和成果转化效率均值分别为0.209和0.519,高质量发展企业两阶段效率明显高于中低质量发展企业,共同前沿下效率值均不超过群组前沿下效率值.②三类企业TGR值差异明显,高-低质量发展企业间两阶段技术差距分别为0.516和0.245.高质量发展企业两阶段效率损失主要源于企业管理不当,中低质量发展企业则因技术水平落后和管理无效均造成一定效率损失,2017年低质量发展企业绿色研发TGRI占比高达56.1％.③政府环保支出、外资开放有助于缓解绿色研发TGRI,而收缴排污费、政府科技支持有利于降低成果转化TGRI,经济发展水平则对两阶段TGRI下降均具有积极影响.国有控股有利于降低绿色研发MI,而消化吸收能力对缓解成果转化MI具有积极影响,创新氛围则有利于减少两阶段MI.