使用多特征联合变量的支持向量机方法预测外膜蛋白

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外膜蛋白(Outer Membrane Proteins,OMPs)是一类具有重要生物功能的蛋白质,通过生物信息学方法来预测OMPs能够为预测OMPs的二级和三级结构以及在基因组发现新的OMPs提供帮助。文中提出计算蛋白质序列的氨基酸含量特征、二肽含量特征和加权多阶氨基酸残基指数相关系数特征,将三类特征组合,采用支持向量机(Support Vector Machine,SVM)算法来识别OMPs。计算了包括四种残基指数的多种组合特征的识别结果,并且讨论了相关系数的阶次和权值对预测性能的影响。在数据集上的十
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