隐匿性乙型肝炎病毒感染者病毒S基因的适应性进化分析

来源 :中华微生物学和免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jplayer2
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目的 检测隐匿性乙型肝炎病毒( HBV )感染者病毒S基因的适应性进化现象,验证隐匿性HBV感染现象的分子机制。方法 GenBank中下载隐匿性HBV感染者病毒S基因及HBV各基因型参考株序列,PAML4.07软件检测其阳性选择位点。结果 Clustal W对位排列、手工比对后共获得174条隐匿性HBV感染者病毒S基因。 PAML4.07软件包CODEML程序中,LRT法检验分析结果显示选择模型均显著优于中性模型,优化模型M8( BEB法)共检出14个阳性选择位点,其中有8个位点位于外膜蛋白免疫表位区。 HBV各基因型参考株S基因仅检出2个阳性选择位点。结论隐匿性HBV感染者病毒S基因在宿主强烈免疫抑制下发生适应性进化形成免疫逃避株,故病毒能持续存在。

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